Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms