Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC10A1Q14973 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms