Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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