Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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