Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX2Q14781 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms