Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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EBI3Q14213 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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EBI3Q14213 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBI3Q14213 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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