Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
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