Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
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CAPSQ13938 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CAPSQ13938 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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CAPSQ13938 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CAPSQ13938 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CAPSQ13938 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CAPSQ13938 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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