Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H2Q13888 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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