Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF5Q13568 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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