Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms