Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATMQ13315 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATMQ13315 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ATMQ13315 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATMQ13315 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ATMQ13315 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ATMQ13315 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATMQ13315 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATMQ13315 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATMQ13315 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATMQ13315 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATMQ13315 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATMQ13315 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATMQ13315 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATMQ13315 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATMQ13315 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATMQ13315 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATMQ13315 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATMQ13315 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATMQ13315 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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