Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms