Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PTP4A2Q12974 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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