Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FOXF2Q12947 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FOXF2Q12947 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FOXF2Q12947 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FOXF2Q12947 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FOXF2Q12947 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FOXF2Q12947 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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FOXF2Q12947 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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FOXF2Q12947 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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FOXF2Q12947 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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