Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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TP53BP1Q12888 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TP53BP1Q12888 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TP53BP1Q12888 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TP53BP1Q12888 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TP53BP1Q12888 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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TP53BP1Q12888 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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TP53BP1Q12888 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TP53BP1Q12888 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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