Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms