Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
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