Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms