Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms