Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms