Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms