Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ERCC6Q03468 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms