Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms