Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms