Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms