Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB1P82279 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB1P82279 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB1P82279 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB1P82279 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB1P82279 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB1P82279 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB1P82279 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB1P82279 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB1P82279 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB1P82279 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB1P82279 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB1P82279 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB1P82279 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB1P82279 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB1P82279 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB1P82279 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB1P82279 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRB1P82279 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRB1P82279 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRB1P82279 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRB1P82279 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRB1P82279 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRB1P82279 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRB1P82279 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRB1P82279 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRB1P82279 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CRB1P82279 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRB1P82279 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CRB1P82279 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRB1P82279 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRB1P82279 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRB1P82279 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRB1P82279 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB1P82279 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRB1P82279 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRB1P82279 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRB1P82279 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRB1P82279 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRB1P82279 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRB1P82279 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRB1P82279 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRB1P82279 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRB1P82279 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CRB1P82279 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRB1P82279 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRB1P82279 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRB1P82279 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms