Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS3AP61247 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms