Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFDNP55196 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFDNP55196 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFDNP55196 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFDNP55196 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFDNP55196 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFDNP55196 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFDNP55196 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFDNP55196 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFDNP55196 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFDNP55196 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFDNP55196 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFDNP55196 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFDNP55196 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFDNP55196 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFDNP55196 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFDNP55196 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFDNP55196 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFDNP55196 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFDNP55196 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFDNP55196 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AFDNP55196 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFDNP55196 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFDNP55196 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFDNP55196 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFDNP55196 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFDNP55196 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFDNP55196 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
AFDNP55196 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AFDNP55196 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AFDNP55196 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AFDNP55196 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
AFDNP55196 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
AFDNP55196 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AFDNP55196 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFDNP55196 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFDNP55196 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms