Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HADHBP55084 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HADHBP55084 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HADHBP55084 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms