Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MVDP53602 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MVDP53602 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MVDP53602 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MVDP53602 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MVDP53602 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MVDP53602 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MVDP53602 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MVDP53602 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MVDP53602 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MVDP53602 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MVDP53602 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MVDP53602 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MVDP53602 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MVDP53602 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MVDP53602 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MVDP53602 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MVDP53602 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MVDP53602 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MVDP53602 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms