Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBP2P50120 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBP2P50120 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBP2P50120 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBP2P50120 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBP2P50120 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBP2P50120 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBP2P50120 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBP2P50120 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms