Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK8P49336 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK8P49336 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK8P49336 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK8P49336 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK8P49336 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK8P49336 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK8P49336 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK8P49336 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK8P49336 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK8P49336 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK8P49336 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK8P49336 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK8P49336 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK8P49336 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK8P49336 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK8P49336 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK8P49336 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK8P49336 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK8P49336 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK8P49336 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK8P49336 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms