Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RANGAP1P46060 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RANGAP1P46060 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RANGAP1P46060 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RANGAP1P46060 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RANGAP1P46060 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RANGAP1P46060 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RANGAP1P46060 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RANGAP1P46060 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RANGAP1P46060 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RANGAP1P46060 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
RANGAP1P46060 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RANGAP1P46060 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RANGAP1P46060 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RANGAP1P46060 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
RANGAP1P46060 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RANGAP1P46060 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RANGAP1P46060 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms