Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER2P43116 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms