Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCAPD3P42695 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NCAPD3P42695 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms