Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms