Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTX2P32243 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 289.6 ms