Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMPK1P30085 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms