Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABRB3P28472 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms