Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA1P25391 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA1P25391 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA1P25391 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA1P25391 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA1P25391 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA1P25391 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA1P25391 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA1P25391 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA1P25391 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA1P25391 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA1P25391 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA1P25391 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA1P25391 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA1P25391 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms