Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms