Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSPP15924 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSPP15924 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSPP15924 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSPP15924 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms