Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME1P15531 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME1P15531 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME1P15531 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME1P15531 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME1P15531 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME1P15531 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NME1P15531 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME1P15531 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME1P15531 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME1P15531 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME1P15531 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME1P15531 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME1P15531 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms