Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD46P15529 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD46P15529 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD46P15529 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD46P15529 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD46P15529 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD46P15529 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD46P15529 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD46P15529 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD46P15529 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD46P15529 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD46P15529 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD46P15529 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD46P15529 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD46P15529 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD46P15529 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD46P15529 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms