Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TOP2AP11388 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC33.82■■■■□ 3
TOP2AP11388 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TOP2AP11388 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TOP2AP11388 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
TOP2AP11388 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TOP2AP11388 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TOP2AP11388 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TOP2AP11388 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2AP11388 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2AP11388 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2AP11388 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2AP11388 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2AP11388 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2AP11388 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2AP11388 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2AP11388 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2AP11388 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2AP11388 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2AP11388 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TOP2AP11388 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TOP2AP11388 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TOP2AP11388 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TOP2AP11388 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TOP2AP11388 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TOP2AP11388 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TOP2AP11388 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TOP2AP11388 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC33.78■■■■□ 3
TOP2AP11388 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TOP2AP11388 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TOP2AP11388 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TOP2AP11388 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TOP2AP11388 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TOP2AP11388 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TOP2AP11388 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TOP2AP11388 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
TOP2AP11388 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
TOP2AP11388 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TOP2AP11388 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TOP2AP11388 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TOP2AP11388 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TOP2AP11388 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TOP2AP11388 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TOP2AP11388 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TOP2AP11388 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TOP2AP11388 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TOP2AP11388 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC33.76■■■■□ 3
TOP2AP11388 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
TOP2AP11388 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
TOP2AP11388 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC33.76■■■■□ 3
TOP2AP11388 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms