Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNB1P11230 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms