Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms