Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms