Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PARP1P09874 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PARP1P09874 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PARP1P09874 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PARP1P09874 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PARP1P09874 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP1P09874 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP1P09874 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP1P09874 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP1P09874 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP1P09874 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP1P09874 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP1P09874 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP1P09874 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP1P09874 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP1P09874 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP1P09874 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP1P09874 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP1P09874 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP1P09874 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP1P09874 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP1P09874 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP1P09874 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP1P09874 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP1P09874 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP1P09874 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP1P09874 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP1P09874 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP1P09874 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP1P09874 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP1P09874 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP1P09874 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP1P09874 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP1P09874 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP1P09874 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP1P09874 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP1P09874 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP1P09874 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP1P09874 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP1P09874 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP1P09874 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP1P09874 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP1P09874 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms